南京新百与控股股东的同业竞争问题已是老生常谈，却历久弥新。2009年3月30日, 通过包括定向增发在内的一揽子重组议案，南京新百向由王恒执掌的金鹰国际集团定向增发，收购后者商业地产开发和运营业务，变更现有主营业务百货经营，从而消除与金鹰国际集团在港上市公司金鹰商贸之间的同业竞争。但该增发议案遭到媒体质疑为“低买高卖”，并最终流产。

　　会上，管理层纷纷表示公司主营业务发展确实受此制约良久，但对解决意向只字不提。会上有股东提出，希望公司可选择更合适的控股股东，比如二股东南京市国有资产经营（控股）有限公司。

　　南京新百去年零售业务经营虽然受到群楼围挡施工的不利影响，仍实现全年营收增幅22%。总经理傅敦汛表示，主楼南京中心招租工作去年10月迎来第一家入驻公司后，目前已签约7家企业，完成租赁面积1万多平米。主楼租售并举，出租面积3万平米，每平米租金标准约4.2元；出售部分约4万平米，每平米均价在3.2万元，国际房地产顾问“五大行”之一戴德梁行代理售租，项目目前处于蓄水阶段。另外，南京河西地块土地归属等遗留问题已基本解决，与盐城内港湖项目启动都将有助于公司盘活存量资产，实现中长期收益。

　　新百药业公司业绩增长迅速，跨入亿元产值制药企业行列，去年销售同比增长71%，是公司成立以来的最好业绩。傅敦汛介绍：“目前公司与研究所合作研发产品，由代理商销售，药品出厂价按国家相关药品规定，因此流通环节利润被代理商占去，但目前不考虑组建自己的销售团队。”

　　值得一提的是，傅敦汛还透露，南京新百于今年3月份推出两项重大内部改革，其一推行购销分离，破解中间环节利益关系，降低采购成本；其二对商品部、营销部等重要岗位推行干部竞聘，打破原先国有体制论资排辈的用人模式，提高公司活力。